Thắc mắc: Nếu Công ty phát hiện ra kê khai sai/sót hóa đơn đầu vào hoặc đầu ra hoặc xuất hóa đơn điều chỉnh thay thế cho doanh thu đã kê khai thuế thì Công ty sẽ thực hiện kê khai điều chỉnh thế nào theo Quy định của Luật thuế theo từng thời kỳ.
Ở bài viết này mình xin trình bày quan điểm cá nhân dựa vào cách đọc hiểu luật và các công văn của cơ quan thuế ban hành bao gồm Công văn 1592/CT-NVT ngày 05/06/2025 và Công văn 7973/CCTKV.XVI-QLDN2 ngày 20/05/2025.
Theo Công văn 1592/CT-NVT:
Theo báo cáo của Chi cục Thuế khu vực XIII nêu, trường hợp người nộp thuế khai bổ sung hồ sơ khai thuế giá trị gia tăng và kết quả theo hồ sơ khai bổ sung chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế giá trị gia tăng chưa khấu trừ hết của kỳ tính thuế có sai sót thì lập hồ sơ khai bổ sung theo quy định, số tiền thuế giá trị gia tăng điều chỉnh tăng hoặc giảm khấu trừ của kỳ tính thuế có sai sót khai vào chỉ tiêu [38] “Điều chỉnh tăng thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ của các kỳ trước” hoặc chỉ tiêu [37] “Điều chỉnh giảm số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ của các kỳ trước” trên tờ khai thuế giá trị gia tăng của kỳ tính thuế hiện tại (kỳ còn trong thời hạn khai thuế) là đáp ứng quy định tại khoản 4 Điều 7 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ.
và Theo Công văn 7973/CCTKV.XVI-QLDN2 thì:
“Chi cục Thuế khu vực XVI nhận được văn bản không số ngày 08/05/2025 của CÔNG TY TNHH RHEEM VIỆT NAM (gọi tắt là “Công ty”) về việc khai bổ sung hồ sơ khai thuế bị sai sót.
Qua nội dung văn bản nói trên, Chi cục Thuế khu vực XVI có ý kiến như sau:
Tại Điều 47, Điều 151 Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 ngày 13/06/2019 quy định:
“Điều 47. Khai bổ sung hồ sơ khai thuế
- Người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai, sót thì được khai bổ sung hồ sơ khai thuế trong thời hạn 10 năm kể từ ngày hết thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế có sai, sót nhưng trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra.
- Khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền đã công bố quyết định thanh tra, kiểm tra thuế tại trụ sở của người nộp thuế thì người nộp thuế vẫn được khai bổ sung hồ sơ khai thuế; cơ quan thuế thực hiện xử phạt vi phạm hành chính về quản lý thuế đối với hành vi quy định tại Điều 142 và Điều 143 của Luật này.
- Sau khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền đã ban hành kết luận, quyết định xử lý về thuế sau thanh tra, kiểm tra tại trụ sở của người nộp thuế thì việc khai bổ sung hồ sơ khai thuế được quy định như sau:
- a) Người nộp thuế được khai bổ sung hồ sơ khai thuế đối với trường hợp làm tăng số tiền thuế phải nộp, giảm số tiền thuế được khấu trừ hoặc giảm số tiền thuế được miễn, giảm, hoàn và bị xử phạt vi phạm hành chính về quản lý thuế đối với hành vi quy định tại Điều 142 và Điều 143 của Luật này;
- b) Trường hợp người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế có sai, sót nếu khai bổ sung làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc làm tăng số tiền thuế được khấu trừ, tăng số tiền thuế được miễn, giảm, hoàn thì thực hiện theo quy định về giải quyết khiếu nại về thuế.”
“Điều 151. Hiệu lực thi hành
- Luật này có hiệu lực thi hành từ ngày 01 tháng 7 năm 2020, trừ trường hợp quy định tại khoản 2 Điều này.”
Tại Khoản 6 Điều 6 và Điều 10 Luật Quản lý thuế số 56/2024/QH15 ngày 29/11/2024 sửa đổi, bổ sung một số điều của một số Luật trong đó có Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 ngày 13/06/2019 quy định:
“Điều 6. Sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Quản lý thuế
- Sửa đổi, bổ sung, bãi bỏ một số khoản của Điều 47 như sau:
- a) Sửa đổi, bổ sung khoản 1 như sau:
“1. Người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai, sót thì được khai bổ sung hồ sơ khai thuế trong thời hạn 10 năm kể từ ngày hết thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế có sai, sót trong trường hợp sau đây:
- a) Trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra;
- b) Hồ sơ không thuộc phạm vi, thời kỳ thanh tra, kiểm tra thuế nêu tại quyết định thanh tra, kiểm tra thuế.
Đối với những nội dung thuộc phạm vi thanh tra, kiểm tra, người nộp thuế được bổ sung hồ sơ giải trình theo quy định của pháp luật về thuế, pháp luật về thanh tra và các trường hợp thực hiện theo kết luận, quy định của cơ quan chuyên ngành có thẩm quyền liên quan đến nội dung xác định nghĩa vụ thuế của người nộp thuế.
- b) Bãi bỏ khoản 2 và khoản 3.
“Điều 10. Hiệu lực thi hành
- Luật này có hiệu lực thi hành từ ngày 01 tháng 01 năm 2025, trừ trường hợp quy định tại các khoản 2, 3, 4 và 5 Điều này.”
Căn cứ các quy định nêu trên, Chi cục Thuế khu vực XVI trả lời về nguyên tắc như sau:
Trường hợp Công ty phát hiện hồ sơ khai thuế của nhiều kỳ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai, sót thì Công ty thực hiện theo đúng quy định nêu trên cho từng trường hợp cụ thể và hồ sơ khai thuế phải đáp ứng điều kiện về thời hạn. Việc thực hiện khai thuế, khai bổ sung hồ sơ khai thuế Công ty phải áp dụng hiệu lực thi hành của văn bản quy phạm pháp luật tương ứng từng thời kỳ.
Đề nghị Công ty căn cứ tình hình thực tế, đồng thời đối chiếu với quy định tại các văn bản pháp luật về thuế để áp dụng đúng theo quy định.
Trên đây là ý kiến của Chi cục Thuế khu vực XVI trả lời cho Công ty biết để thực hiện./.”
Do đó, theo ý kiến nêu tại các công văn thì có thể hiểu như sau:
Theo Điểm 4, Điều 7 của Nghị Định 126/2020/NĐ-CP thì:
“b) Người nộp thuế khai bổ sung dẫn đến tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế đã được ngân sách nhà nước hoàn trả thì phải nộp đủ số tiền thuế phải nộp tăng thêm hoặc số tiền thuế đã được hoàn thừa và tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước (nếu có).
Trường hợp khai bổ sung chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ chuyển kỳ sau thì phải kê khai vào kỳ tính thuế hiện tại. Người nộp thuế chỉ được khai bổ sung tăng số thuế giá trị gia tăng đề nghị hoàn khi chưa nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế tiếp theo và chưa nộp hồ sơ đề nghị hoàn thuế.”
[Ý kiến của chuyên gia]: Do đó, nếu theo quy định tại Điểm 4, Điều 7 của Nghị định 126 và câu trả lời của Cơ quan thuế thì có rủi ro là nếu như kê khai sai, sót của kỳ tính thuế trong quá khứ nhưng việc kê khai sai/sót này làm tăng/giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ sang kỳ sau thì phải quay lại điều chỉnh ở kỳ kê khai sai/sót trong quá khứ và sau đó sẽ phản ánh ở chỉ tiêu [37] hoặc [38] trên tờ khai thuế GTGT của kỳ thuế hiện tại.
“thì lập hồ sơ khai bổ sung theo quy định, số tiền thuế giá trị gia tăng điều chỉnh tăng hoặc giảm khấu trừ của kỳ tính thuế có sai sót khai vào chỉ tiêu [38] “Điều chỉnh tăng thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ của các kỳ trước” hoặc chỉ tiêu [37] “Điều chỉnh giảm số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ của các kỳ trước” trên tờ khai thuế giá trị gia tăng của kỳ tính thuế hiện tại”
Trước Luật thuế GTGT số 48 thì cũng có những công văn hướng dẫn của Tổng Cục thuế nhưng vẫn không khẳng định rõ ràng mà có vẻ như cũng yêu cầu người nộp thuế tham khảo lại các quy định của Luật Quản Lý Thuế số 38 và Nghị Định 126 như Công văn 2718:
Nếu chiếu theo cách hiểu trên, thì khi phát hiện ra hóa đơn bỏ sót thì theo quy định trước ngày 1/7/2025 thì Công ty cần quay lại kê khai tại kỳ phát sinh sai sót như Công văn bên dưới của Cục thuế Bắc Ninh:
“Căn cứ quy định và hướng dẫn nêu trên, trường hợp Công ty phát hiện hoá đơn đầu vào các tháng trước chưa kê khai thì Công ty được khai bổ sung hồ sơ khai thuế theo hướng dẫn tại Điều 47 Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 ngày 13/06/2019 của Quốc hội và khoản 4 Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2022 của Chính phủ. Tức là:
– Kê khai bổ sung hóa đơn GTGT đầu vào bị bỏ sót tháng 9 năm 2022 vào tờ
khai tháng 9 năm 2022;
– Kê khai bổ sung hóa đơn GTGT đầu vào bị bỏ sót tháng 12 năm 2022 vào tờ khai tháng 12 năm 2022;
– Kê khai bổ sung hóa đơn GTGT đầu vào bị bỏ sót tháng 1 năm 2023 vào tờ khai tháng 1 năm 2023;”
Tuy nhiên, theo Luật thuế GTGT số 48 có hiệu lực từ 01/07/2025 thì:
đ) Thuế giá trị gia tăng đầu vào phát sinh trong tháng, quý nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế phải nộp của tháng, quý đó. Số thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết trong tháng, quý thì được khấu trừ vào tháng, quý tiếp theo.
Trường hợp cơ sở kinh doanh phát hiện số thuế giá trị gia tăng đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị sai, sót thì được khai thuế trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế như sau:
Người nộp thuế thực hiện khai bổ sung vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế được hoàn; người nộp thuế phải nộp đủ số tiền thuế phải nộp tăng thêm hoặc bị thu hồi số tiền thuế đã được hoàn tương ứng và nộp tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước (nếu có).
Người nộp thuế thực hiện khai vào tháng, quý phát hiện sai, sót nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ chuyển sang tháng, quý sau;
[Ý kiến của Chuyên gia]: Như vậy, nếu căn cứ theo Quy định của Luật thuế GTGT số 48 thì đã rõ ràng hơn về việc Doanh nghiệp có thể kê khai vào kỳ phát hiện ra số thuế GTGT đầu vào bị sai, sót nếu việc điều chỉnh vào kỳ phát sinh làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm tăng, hay giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển sang tháng/quý sau.
Ngoài ra, theo Công văn7973/CCTKV.XVI-QLDN2 thì có thể hiểu từ khi Luật quản lý số 56/2024/QH15 ngày 29/11/2024 có hiệu lực từ 01/01/2025 thì Công ty sẽ CHỈ được phép kê khai bổ sung trước khi cơ quan thuế thực hiện Công bố quyết định thanh kiểm tra. Trước đây, theo câu từ của Luật Quản lý thuế thì vẫn được phép kê khai bổ sung ngay cả khi cơ quan thuế tiến hành công bố Quyết định kiểm tra.
